Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Phf11bB4XVQ1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Phf11bB4XVQ1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Phf11bB4XVQ1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11bB4XVQ1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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