Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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