Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ckap5A2AGT5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms