Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms