Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms