Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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