Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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