Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms