Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmed2Q9R0Q3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmed2Q9R0Q3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms