Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vav3Q9R0C8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms