Protein–RNA interactions for Protein: Q9R022

Dnajc12, DnaJ homolog subfamily C member 12, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc12Q9R022 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dnajc12Q9R022 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajc12Q9R022 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajc12Q9R022 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dnajc12Q9R022 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms