Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tomm40Q9QYA2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms