Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim44Q9QXA7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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