Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms