Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms