Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Col5a3Q9JLI2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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