Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms