Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Isg20Q9JL16 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Isg20Q9JL16 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms