Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms