Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trem1Q9JKE2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms