Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Scamp5Q9JKD3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms