Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trim39Q9ESN2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trim39Q9ESN2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms