Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQB9

Znf287, Zinc finger protein 287, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf287Q9EQB9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf287Q9EQB9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Znf287Q9EQB9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf287Q9EQB9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Znf287Q9EQB9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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