Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tbx18Q9EPZ6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms