Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Hmg20aQ9DC33 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms