Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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