Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms