Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms