Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a2Q9D8F3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms