Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms