Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms