Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrameQ9D4Z5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms