Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tmem35aQ9D328 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem35aQ9D328 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms