Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms