Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fndc8Q9D2H8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms