Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms