Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Xrcc3Q9CXE6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Xrcc3Q9CXE6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms