Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms