Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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