Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms