Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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Nicn1Q9CQM0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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