Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms