Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms