Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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