Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krt88Q9CPR6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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