Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bcl11bQ99PV8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcl11bQ99PV8 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms