Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Bhlhe41Q99PV5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms