Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad54l2Q99NG0 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad54l2Q99NG0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms