Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rims1Q99NE5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rims1Q99NE5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rims1Q99NE5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rims1Q99NE5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms