Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl1Q99N96 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl1Q99N96 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl1Q99N96 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms